液體混合物沿加熱板流動和加熱時，輕、重分子從液體表面逸出，進入氣象。由于輕、中分子的自由路徑不同，不同的物質(zhì)在分子脫離液面后的移動距離不同。如果能適當設(shè)置冷凝板，則輕分子會遇到冷凝板，凝結(jié)排出，但重分子達不到冷凝板，沿混合液排出。這樣就能達到物質(zhì)分離的目的。

　　短程分子蒸餾有帶加熱夾具的圓柱桶、轉(zhuǎn)子和內(nèi)置冷凝器。轉(zhuǎn)子的固定框架上裝有刮刀和防濺裝置。內(nèi)置冷凝器在蒸發(fā)器上，轉(zhuǎn)子在圓柱形槍管和冷凝器之間旋轉(zhuǎn)。從加熱面流出的硬分子與短路線幾乎不沖突，在內(nèi)置冷凝器中凝結(jié)，沿著冷凝器管道流動，通過蒸發(fā)器底部的排出管排出。殘液是重分子從加熱區(qū)下的圓形通道收集并通過側(cè)面排出管流出的。

　　夾具的長度和段根據(jù)提供能量的路徑、冷凝器結(jié)構(gòu)和刮刀的特定尺寸等參數(shù)來明確。如果能量是導(dǎo)熱油，則可以在夾具內(nèi)設(shè)置導(dǎo)流板，加強加熱器的蒸發(fā)傳熱過程。

　　筒體要與上、下頭部形成密封空腔，短距離分子蒸餾器連接處采用密封結(jié)構(gòu)，滿足分子蒸餾過程的嚴格要求。在某些條件下，還必須考慮磁流體密封結(jié)構(gòu)，如果系統(tǒng)需要，可以考慮磁力驅(qū)動設(shè)計，軸上的動態(tài)密封將轉(zhuǎn)換為靜態(tài)密封，以滿足真空度的要求。為了去除吸附在設(shè)備上的空氣或揮發(fā)性非冷凝成分，安裝原料液去除器可以根據(jù)系統(tǒng)的不同要求以多種形式設(shè)計。也就是說，墻壁反射式、填料式、層板式、降膜式等。也有使用刮刀薄膜蒸發(fā)器作為原料液除氣器的。